গুগল ডিপমাইন্ড আলফাজেনোম অ্যাটলাস প্রকাশ করেছে, যা মানুষের জিনোমের প্রতিটি সম্ভাব্য একক নিউক্লিওটাইড বৈকল্পিকের আণবিক প্রভাবের জন্য প্রাক-গণনা করা ভবিষ্যদ্বাণীগুলির একটি ক্যাটালগ। এটি একটি চিঠিতে প্রায় 9 বিলিয়ন পরিবর্তন। রিলিজটি আলফাজেনোম ভেরিয়েন্ট ইমপ্যাক্ট (এভিআই) স্কোরও প্রবর্তন করে, একটি একক সংখ্যা যা প্রত্যাশিত প্রভাব দ্বারা ভেরিয়েন্টকে র্যাঙ্ক করে, এছাড়াও প্রতিটি ভেরিয়েন্টের বৈশিষ্ট্য অ্যাট্রিবিউশন এবং জিনোম-ওয়াইড মোটিফগুলির একটি সংগ্রহ। সংস্থানটি একাডেমিক ব্যবহারের জন্য একটি বিনামূল্যের ওয়েব পোর্টাল হিসাবে, AlphaGenome API-এর মাধ্যমে এবং Google Antigravity দক্ষতা হিসাবে বিতরণ করা হয়।
এটা কি স্থাপনযোগ্য? আংশিকভাবে পোর্টাল এবং API-এর মাধ্যমে অ-বাণিজ্যিক গবেষণার জন্য অ্যাটলাস আজ জিজ্ঞাসাযোগ্য, এবং Google ক্লাউডে বাণিজ্যিক অ্যাক্সেস “শীঘ্রই আসছে” হিসাবে তালিকাভুক্ত করা হয়েছে। মৌলিক AlphaGenome মডেলটি ইতিমধ্যেই GitHub-এ একাডেমিক ব্যবহারের জন্য এবং Google ক্লাউডে মডেল গার্ডেনে বাণিজ্যিক ব্যবহারের জন্য উপলব্ধ।
একটি জিনোম প্রশস্ত মানচিত্রের জন্য একটি নমুনা
2025 সালের জুনে প্রকাশিত, আলফাজেনোম ভবিষ্যদ্বাণী করে যে কীভাবে একটি ডিএনএ বৈকল্পিক আণবিক প্রক্রিয়া যেমন জিন এক্সপ্রেশন এবং আরএনএ স্প্লিসিংয়ের মতো পরিবর্তন করে। এটি ব্যাপকভাবে ব্যবহৃত হয়, তবে সর্বদা একটি সংস্করণ বা এক সময়ে একটি অঞ্চল। অ্যাটলাস কাজের একক পরিবর্তন করে। ডিপমাইন্ড দলটি 9 বিলিয়ন একক নিউক্লিওটাইড ভেরিয়েন্টের উপর AlphaGenome চালায় এবং আউটপুটগুলি সংরক্ষণ করে, একটি 1 পেটাবাইট ডেটাসেট তৈরি করে। এটি আলফাফোল্ড ডাটাবেসের চেয়ে 30 গুণ বড়, যাতে 200 মিলিয়নেরও বেশি প্রোটিন গঠনের পূর্বাভাস রয়েছে।
ল্যাবে 9 বিলিয়ন মিউটেশন স্ক্রীন করা অব্যবহারিক, এবং জিনোম-স্কেল অধ্যয়নের জন্য প্রতিটি প্রার্থীর ভেরিয়েন্টের চাহিদা অনুযায়ী একটি বড় মডেল চালানো ধীর। একটি টীকাযুক্ত লুকআপ টেবিল উভয় বাধা দূর করে।
এটলাসের ভিতরে কি আছে?
অ্যাটলাস 4টি লিঙ্কযুক্ত সংস্থান প্রকাশ করে:
- আণবিক প্রভাবের পূর্বাভাস: ভেরিয়েন্ট প্রতি হাজার হাজার ভবিষ্যদ্বাণী, শত শত মানব এবং মাউস কোষের ধরন এবং টিস্যু জুড়ে জিন নিয়ন্ত্রণের একাধিক দিক কভার করে।
- AVI স্কোর: সংস্করণ প্রতি একটি একক প্রভাব সংখ্যা। এটি আলফাজেনোমের নিয়ন্ত্রক ভবিষ্যদ্বাণীগুলিকে আলফামিসেন্সের সাথে একত্রিত করে, ডিপমাইন্ডের প্রোটিন-পরিবর্তনকারী রূপের মডেল, তাই এটি কোডিং অঞ্চলে (জিনোমের প্রায় 2%) এবং নন-কোডিং অঞ্চলে (অন্য 98%) উভয় ক্ষেত্রেই কাজ করে।
- AVI গুণাবলী বৈশিষ্ট্যযুক্ত: প্রতিটি স্কোর ক্রোমাটিন অ্যাক্সেসিবিলিটি, স্প্লিসিং এবং সংরক্ষণের মতো ব্যাখ্যাযোগ্য বিভাগ থেকে অতিরিক্ত অবদানের মধ্যে পচনশীল হয়, তাই একজন গবেষক দেখতে পারেন যে কোন প্রক্রিয়াটি ব্যাহত হতে পারে।
- ডিএনএ ক্রম মোটিফ: ট্রান্সক্রিপশন ফ্যাক্টর বাইন্ডিং সাইট সহ জিনোমিক অবস্থান সহ 2,500 টিরও বেশি সংক্ষিপ্ত পুনরাবৃত্তিমূলক ক্রমগুলির একটি সংকলন৷
ডিপমাইন্ড টিম রিপোর্ট করেছে যে AVI স্কোর একাধিক বৈকল্পিক প্যাথোজেনিসিটি এবং বিরল রোগের মেট্রিক্স জুড়ে সেরা-ইন-ক্লাস পারফরম্যান্স প্রদান করে। প্রযুক্তিগত প্রতিবেদনে তুলনার বিবরণ রয়েছে।
মানুষের জিনোমে 9 বিলিয়ন একক অক্ষর পরিবর্তনের প্রতিটির জন্য অ্যাটলাসে ইতিমধ্যে একটি প্রাক-গণনা করা ভবিষ্যদ্বাণী রয়েছে। এই ডেমো দেখায় কি একটি একক অনুসন্ধান রিটার্ন.
1. এক বেস মট
এটি প্রতিস্থাপন করতে কোনো অক্ষর ক্লিক করুন. কোডিং ঘাঁটি একটি AlphaMissense প্রোটিন শব্দ দেওয়া হয়; নন-কোডিং বেসগুলি শুধুমাত্র আলফাজেনোমের উপর নির্ভর করে।
কোডিং (2%)কোন কোডিং নেই (98%)
AlphaGenome ভেরিয়েন্ট ইমপ্যাক্ট (AVI)
0.00
কোনো সংস্করণ নির্বাচন করা হয়নি।
দৃষ্টান্তমূলক সংখ্যা। গ্রিডগুলি যেভাবে অ্যাটলাস একটি AVI স্কোরকে অতিরিক্ত বৈশিষ্ট্য বৈশিষ্ট্যগুলিতে ভাগ করে তার অনুকরণ করে৷ আসল মানগুলি পোর্টাল অ্যাটলাস থেকে আসে, এই উইজেট নয়।
2. কিভাবে এটলাস নির্মিত হয়
9B সংস্করণ→
আলফাজিনোম→
হাজার হাজার আণবিক প্রভাব→
AVI স্কোর→
অ্যাট্রিবিউশন + 2,500+ মোটিফ
0একক নিউক্লিওটাইড ভেরিয়েন্টের স্কোরিং
0ডেটাসেটের আকার, আলফাফোল্ড ডাটাবেসের চেয়ে 30 গুণ বড়
054,000+ ইউকে বায়োব্যাঙ্ক জিনোমে অতিরিক্ত নন-কোডিং অ্যাসোসিয়েশন পাওয়া গেছে
0পুনরাবৃত্তিমূলক ডিএনএ মোটিফ তালিকাভুক্ত করা হয়
বহিরাগত সহযোগীদের থেকে প্রাথমিক ফলাফল
তিনটি গবেষণা গোষ্ঠী লঞ্চের আগে অ্যাটলাস ব্যবহার করে এবং তাদের ফলাফল ঘোষণার ব্যাক আপ করে:
- একটি বিরল রোগ: GREGoR কনসোর্টিয়ামের সাথে কাজ করে, ব্রড ইনস্টিটিউটে লরা কোভিল এবং অ্যান ও’ডোনেল-লুরিয়া পূর্ববর্তী বিশ্লেষণগুলি উপেক্ষা করা রূপগুলিকে পুনরায় অগ্রাধিকার দিতে AVI স্কোর ব্যবহার করেছেন৷ স্কোর পপ আপ ভেরিয়েন্ট B DNM1মৃগী এনসেফালোপ্যাথির সাথে দৃঢ়ভাবে যুক্ত একটি জিন। আলফাজেনোমের প্রাথমিক ভবিষ্যদ্বাণীগুলি প্রক্রিয়াটি দেখিয়েছিল: প্রকরণটি একটি ভুল-বিভক্ত সাইট তৈরি করেছিল যা ফলস্বরূপ প্রোটিনকে অস্বাভাবিকভাবে প্রসারিত করেছিল। পরীক্ষামূলক স্ক্রিনগুলি ভবিষ্যদ্বাণীটি যাচাই করেছে এবং অনুরূপ প্রভাবগুলির সাথে ঘনিষ্ঠ রূপগুলি খুঁজে পেয়েছে৷
- জনসংখ্যা জেনেটিক্স: গ্যারেথ হকস, এক্সেটার ইউনিভার্সিটির মেডিকেল রিসার্চ কাউন্সিলের ফেলো, 54,000 ইউকে বায়োব্যাঙ্কের অংশগ্রহণকারীদের থেকে পুরো-জিনোম ডেটাতে অ্যাটলাস প্রয়োগ করেছেন। পূর্বাভাসিত আণবিক প্রভাব দ্বারা বিরল রূপগুলিকে গোষ্ঠীবদ্ধ করা অন্যথায় সনাক্ত করা যেত তার চেয়ে 22% বেশি ননকোডিং অ্যাসোসিয়েশন প্রকাশ করেছে, যেগুলি PLA2G7 এবং EGLN1 এর মতো প্রোটিনের সঞ্চালন স্তরগুলিকে চালিত করে এমন নিয়ন্ত্রক রূপগুলি সনাক্ত করে। 1% নন-কোডিং ভেরিয়েন্টে ফিল্টারিং করে যা অ্যাটলাস সবচেয়ে প্রভাবশালী বলে অনুমান করে, হক্স বডি মাস ইনডেক্সের সাথে যুক্ত 19টি জিনোমিক অঞ্চল চিহ্নিত করেছে।
- নিয়ন্ত্রক ব্যাকরণ: স্টোয়ার্স ইনস্টিটিউট ফর মেডিক্যাল রিসার্চের জুলিয়া জেইটলিংগার এবং মেলানি ওয়েইলার্ট মোটিফ রিসোর্সটি ট্রান্সক্রিপশন ফ্যাক্টরগুলিকে আলাদা করার জন্য ব্যবহার করেছেন যা শুধুমাত্র ডিএনএ অ্যাক্সেসযোগ্যতা পরিবর্তন করে যেগুলি জিন চালু এবং বন্ধ করে।
একটি মূল গ্রহণ
- AlphaGenome Atlas একটি 1-PB ডেটাসেটে 9 বিলিয়ন মানুষের একক-নিউক্লিওটাইড ভেরিয়েন্টের জন্য আণবিক প্রভাবগুলিকে প্রাক-কম্পিউট করে।
- AVI স্কোর AlphaGenome এবং AlphaMissense কে একটি একক সংখ্যায় একীভূত করে যা কোডিং এবং নন-কোডিং ভেরিয়েন্টের জন্য র্যাঙ্ক করা যেতে পারে।
- বৈশিষ্ট্য বৈশিষ্ট্য এবং 2,500 বা তার বেশি মোটিফ ব্যাখ্যা করে কেন একটি বৈকল্পিক উচ্চ স্কোর করে, এবং শুধু তাই নয়।
- সহযোগীরা যাচাইকরণ খুঁজে পেয়েছে DNM1 ইউকে বায়োব্যাঙ্কে 54,000+ জিনোমে স্প্লিসিং ভেরিয়েন্ট এবং 22% বেশি নন-কোডিং অ্যাসোসিয়েশন।
- আজ একাডেমিক ব্যবহারের জন্য একটি বিনামূল্যের পোর্টাল এবং API; বাণিজ্যিক Google ক্লাউড অ্যাক্সেস শীঘ্রই আসছে; ক্লিনিকাল অনুমোদন ছাড়া।
চেক আউট কাগজ, ডিপমাইন্ড ঘোষণাদ গুগল প্রযুক্তিগত পোস্টএবং আপনি অ্যাটলাস পোর্টাল. এছাড়াও, নির্দ্বিধায় আমাদের অনুসরণ করুন কিচিরমিচির এবং আমাদের সাথে যোগ দিতে ভুলবেন না 150k+ ML SubReddit এবং সাইন আপ করুন আমাদের নিউজলেটার. অপেক্ষা করুন! আপনি কি টেলিগ্রামে আছেন? এখন আপনি টেলিগ্রামে আমাদের সাথে যোগ দিতে পারেন।
আপনার GitHub রেপো বা আলিঙ্গন হোমপেজ বা পণ্য প্রকাশ বা ওয়েবিনার, ইত্যাদি প্রচার করতে আমাদের সাথে অংশীদারি করতে হবে? আমাদের সাথে সংযোগ করুন
আসিফ রাজাক হলেন মার্কটেকপোস্ট মিডিয়া ইনকর্পোরেটেডের সিইও। একজন দূরদর্শী উদ্যোক্তা এবং প্রকৌশলী হিসেবে, আসিফ সামাজিক ভালোর জন্য AI এর সম্ভাবনাকে কাজে লাগাতে প্রতিশ্রুতিবদ্ধ। তার সর্বশেষ প্রচেষ্টা হল একটি AI মিডিয়া প্ল্যাটফর্ম, Marktechpost চালু করা, যা মেশিন লার্নিং এবং গভীর শিক্ষার খবরের গভীর কভারেজের জন্য আলাদা যা প্রযুক্তিগতভাবে ভাল এবং ব্যাপক দর্শকদের জন্য বোঝা সহজ। প্ল্যাটফর্মটি প্রতি মাসে 2 মিলিয়নেরও বেশি ভিউ নিয়ে গর্ব করে, যা দর্শকদের মধ্যে এর জনপ্রিয়তাকে চিত্রিত করে।