研究人员提取眼镜蛇毒素以发现膜破坏抗菌肽
对眼镜蛇心脏毒素的计算搜索对 14 种毒液启发的肽进行了结构、抗菌和毒性测试，为人工智能引导的肽发现可以走多远提供了严格的测试。 研究：利用蛇毒心脏毒素发现抗菌肽。图片来源： 库里特·阿夫申 / Shutterstock 该杂志最近的一项研究 NPJ 药物发现 使用计算挖掘、机器学习优先级和实验筛选来识别和评估源自眼镜蛇心脏毒素的候选抗菌肽，以测试受毒素启发的抗菌药物发现途径。 毒液抗菌肽发现的进展与挑战 蛇毒代表了多种生物活性分子的储存库，具有作为抗感染剂的显着前景。毒液衍生的肽和蛋白质经过进化可以破坏猎物和捕食者的细胞和免疫过程，也具有固有的抗菌特性，使其成为药物开发的有希望的模型。然而，依赖于生化分离和功能筛选的传统发现管道受到毒液混合物的复杂性以及与生产更大生物分子相关的挑战的阻碍。 组学技术的最新进展扩大了毒液蛋白质序列数据库，揭示了重要但尚未充分利用的分子多样性。这些数据集通过重述对生物活性至关重要的结构或物理化学基序，使得能够合理设计毒素启发的肽。生物活性肽片段可以编码在更大的毒素序列中，并且仅在释放时才表现出活性。即使有这种潜力，系统性的 计算机模拟 从毒液序列中提取和验证抗菌肽仍然有限。 心脏毒素（环磷酰胺） 从 不 属于三指毒素家族的物种由于其紧凑的尺寸、结构完整性和膜结合特性而特别适合计算肽提取。心脏毒素样碱性蛋白（CLBP）虽然在结构上相关，但在抗菌研究中很大程度上被忽视了。 整合 人工智能 现在，使用毒液可以快速预测抗菌潜力，并确定序列数据中假定的生物活性基序的优先级。然而，将毒素序列挖掘与基于人工智能的肽预测相结合的综合方法尚未得到广泛实施。仍存在关键差距 计算机模拟 蛇毒毒素抗菌肽的鉴定和表征，特别是 CTX 和 CLBP。 CTX 衍生肽的序列分析、设计和功能评估…
